2018年10月12日，"2018年世界运河城市论坛"分论坛之"世界运河城市博物馆馆长论坛"宣布，中国大运河博物馆选址江苏扬州三湾。
2019年5月5日，中国大运河博物馆（筹）奠基仪式在运河三湾风景区举行。
2019年9月27日，中国大运河博物馆正式开工建设。
2020年8月1日，中国大运河博物馆钢结构主体已经建成。主体建筑上部的景观构筑物吊装即将完工，由1.85万吨钢构件打造的中国大运河博物馆“金属身”开始全景呈现。
2020年11月19日，国务院办公厅在中国政府网公开发布《国务院办公厅关于扬州大运河博物馆冠名问题的函》，同意将在扬州建设的大运河博物馆定名为“扬州中国大运河博物馆”。
2021年4月18日，扬州市市长张宝娟在2021中国扬州“烟花三月”国际经贸旅游节开幕式上披露，扬州中国大运河博物馆将于今年6月18日开馆。[3]
2021年6月16日，大运河文化发展论坛暨扬州中国大运河博物馆建成开放活动将在扬州举行。扬州中国大运河博物馆正式开馆迎客。[6]现场，博物馆收到了一大批来自文化界的展品资料捐赠：《大运河文化数字资源库》，中国画《扬州胜迹图》，书法长卷《运河颂》，百米长卷美术精品《中国大运河史诗图卷》，刻纸百米长卷《大运河》，斧劈石盆景《京杭大运河》。[5]
中国大运河博物馆
中国大运河博物馆(筹)整体基调为唐代建筑风格，由中国工程院院士、中国建筑西北设计研究院总建筑师张锦秋领衔设计。博物馆占地200亩，总建筑面积约8万平方米(包括大运塔、车库等)，展陈面积约1.8万平方米(包括文创区等)。
“博物馆整体采用了巨型船只造型，同时融入风帆元素，就像一艘即将扬帆起航的船。”现场专家介绍，博物馆旁还将建造一座高塔，定名大运塔，塔高百米，可通过馆顶建设的长虹卧波式长廊进入高塔。“主塔大运塔，以唐塔的风格设计，将重现唐风古韵。同时，也与文峰寺的文峰塔、高旻寺的天中塔共同形成‘三塔映三湾’的景观。”[1]
中国大运河博物馆
中国大运河博物馆将对大运河进行全流域、全时段的展示，展示内容包括隋唐大运河、京杭大运河、浙东运河的2500年发展历程，以及它对中国历史进程的重大影响。
中国大运河博物馆
大运河塔作为大运河文化带建设的标志性工程，扬州中国大运河博物馆主体部分已基本完工，正在进行内部装修和周边环境提升。100多米高的“大运塔”巍然耸立，博物馆主体部分犹如一艘行驶的巨轮，散发出独特的历史人文气息。图为2021年１月18日拍摄的建设中的扬州中国大运河博物馆。
中国大运河博物馆
2020年11月19日，国务院办公厅发布关于扬州大运河博物馆冠名问题的函，经国务院领导同志同意，现函复如下：在扬州建设的大运河博物馆定名为“扬州中国大运河博物馆”。[2]
2021年9月22日，“中国大运河博物馆”发布公告，中运博将于2021年9月24日起恢复对外开放。[7]
扬州中国大运河博物馆由扬州建设，南京博物院运营，上海飞来飞去展览设计工程有限公司、苏州金螳螂文化发展股份有限公司、江苏爱涛文化产业有限公司负责馆内展陈设计施工一体化。
中国大运河博物馆的展览将全流域、全时段、全方位展览中国大运河的历史和文化。展览的总体定位是“运河带来的美好生活”，共设有“大运河——中国的世界文化遗产”“因运而生——大运河沿岸的传统生活”“大运河两岸非物质文化遗产”“世界知名运河与运河城市”“中国大运河艺术史诗”“紫禁城与大运河”“隋炀帝与大运河”“运河与自然展”“运河上的舟楫”“流动的文化——中国大运河”“探索大运河：青少年互动体验展”等11个专题展。
2021年8月，入选江苏“运河百景”标志性运河文旅产品公示名单。
第11届中国旅游投资艾蒂亚奖公布2021年度130项提名奖榜单，扬州中国大运河博物馆荣获最佳历史文化旅游项目奖。[8]
2022年5月18日，扬州中国大运河博物馆南京博物院的扬州中国大运河博物馆常设展览项目，获得第十九届（2021年度）“全国博物馆十大陈列展览精品”推介项目第7名。[9]
